61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3501 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3501  cellulase  100 
 
 		 346 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  52.07 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  43.5 
 
 		 380 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  43.58 
 
 		 870 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.08 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  42.36 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  40.68 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.42 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.28 
 
 		 491 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  38.74 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  38.74 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  38.74 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  38.59 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  37.62 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  35.65 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  38.15 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  35.57 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 		 495 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.05 
 
 		 437 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  39.35 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  37.84 
 
 		 465 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  36.15 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  35.14 
 
 		 326 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  34.73 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  34.58 
 
 		 448 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  35.59 
 
 		 438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  30.39 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  32.48 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  35.69 
 
 		 361 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  24.59 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  27.49 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.03 
 
 		 469 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  31.35 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  28.96 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  30.31 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  29.22 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  35.55 
 
 		 450 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  28.15 
 
 		 646 aa  92.8  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.03 
 
 		 452 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  29.14 
 
 		 655 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 		 1209 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  27.25 
 
 		 767 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  29.26 
 
 		 501 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  26.96 
 
 		 605 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  25.2 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  32.02 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  24.93 
 
 		 628 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  26.29 
 
 		 611 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.87 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 589 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 620 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.01 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 1128 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  26.26 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  25.93 
 
 		 623 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.76 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  27.76 
 
 		 590 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  26.56 
 
 		 743 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  24.16 
 
 		 596 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  26.43 
 
 		 791 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  25.84 
 
 		 497 aa  46.2  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>