60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  100 
 
 		 359 aa  707    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  46.28 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.2 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  38.25 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  42.71 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  42.11 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  38.89 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  39.66 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  45.82 
 
 		 446 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  37.08 
 
 		 870 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  36.47 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  39.86 
 
 		 459 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  38.51 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.18 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  37.76 
 
 		 487 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.42 
 
 		 491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  45.28 
 
 		 495 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.1 
 
 		 469 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  38.78 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  38.78 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  38.78 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  39.19 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  35.92 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  37.5 
 
 		 439 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  36.58 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  40.08 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  35.16 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  31.32 
 
 		 469 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  33.54 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  33.21 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  26.98 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  39.89 
 
 		 501 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  29.09 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  29.15 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.82 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  38.76 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  29.79 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  29.26 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  30.91 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  29.46 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  25.33 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  24.13 
 
 		 628 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  24.72 
 
 		 623 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  27.39 
 
 		 611 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  24.54 
 
 		 655 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25 
 
 		 639 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  24.84 
 
 		 588 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  24.84 
 
 		 590 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  24.83 
 
 		 596 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  24.32 
 
 		 646 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.04 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 1209 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  23.15 
 
 		 589 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 1128 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.33 
 
 		 633 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 		 620 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  27.32 
 
 		 767 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  24.32 
 
 		 548 aa  43.5  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4253  hypothetical protein  39.51 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  23.89 
 
 		 572 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>