54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0518 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  100 
 
 
371 aa  766    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  49.1 
 
 
350 aa  300  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  49.24 
 
 
394 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  36.18 
 
 
380 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  36.96 
 
 
330 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  36.21 
 
 
341 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  34.1 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  35.67 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  35.67 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  35.67 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  31.29 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  33.22 
 
 
446 aa  126  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  30.74 
 
 
326 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  33.33 
 
 
491 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  31.79 
 
 
341 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  29.28 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  28.22 
 
 
361 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  33.22 
 
 
459 aa  116  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  29.37 
 
 
437 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  31.14 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  30.35 
 
 
439 aa  115  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  27.11 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  33.93 
 
 
469 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  28.62 
 
 
441 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  29.93 
 
 
870 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  31.67 
 
 
359 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  27.93 
 
 
469 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  30.24 
 
 
448 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  25.97 
 
 
501 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  26 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  31.93 
 
 
487 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  25.78 
 
 
434 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  27.1 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  33.46 
 
 
495 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  28.03 
 
 
465 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.8 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  26.57 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  24.08 
 
 
487 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  26.46 
 
 
497 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  24.57 
 
 
655 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  24.48 
 
 
450 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.41 
 
 
633 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  24.85 
 
 
611 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  25.43 
 
 
623 aa  57.4  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.15 
 
 
646 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  23.43 
 
 
628 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
1128 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
1209 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.07 
 
 
639 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  29.45 
 
 
596 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  22.9 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  29.45 
 
 
590 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  29.45 
 
 
588 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.47 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>