61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4617 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4617  cellulase  100 
 
 
341 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  38.51 
 
 
439 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  39.02 
 
 
459 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.25 
 
 
491 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  41.1 
 
 
446 aa  159  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  39.86 
 
 
380 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  39.69 
 
 
870 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.27 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.63 
 
 
469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  36.08 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.91 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  38.58 
 
 
465 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  34.3 
 
 
441 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  35.38 
 
 
448 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  36.2 
 
 
456 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  35.48 
 
 
323 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  38.71 
 
 
330 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  33.7 
 
 
359 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  33.75 
 
 
341 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  40.83 
 
 
495 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  31.79 
 
 
371 aa  122  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  37.6 
 
 
438 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  32.28 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  36.36 
 
 
487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  35.91 
 
 
329 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  35.91 
 
 
329 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  35.91 
 
 
329 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  33.19 
 
 
350 aa  106  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  33.19 
 
 
394 aa  106  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  33.7 
 
 
393 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  33.71 
 
 
361 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  30.66 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  36.9 
 
 
434 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  35.09 
 
 
501 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  29.18 
 
 
469 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  28.1 
 
 
450 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  27.39 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 
1209 aa  70.1  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  29.28 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  27.21 
 
 
548 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  24.31 
 
 
623 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  29.17 
 
 
497 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.17 
 
 
639 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  24.92 
 
 
628 aa  59.3  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  24.84 
 
 
572 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.93 
 
 
633 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 
1128 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  25.53 
 
 
655 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  26.12 
 
 
743 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  24.73 
 
 
611 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.88 
 
 
469 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  26.62 
 
 
646 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.77 
 
 
452 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  25.09 
 
 
767 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 
589 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 
620 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  21.87 
 
 
596 aa  46.2  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  23.39 
 
 
605 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  23.86 
 
 
590 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
968 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  23.86 
 
 
588 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>