21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0271 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  59.62 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  57.69 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  57.69 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  56.31 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  59 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  42.34 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  47.2 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  43.85 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  52.53 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.59 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  50.91 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  34.44 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  34.41 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  30.56 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  33.98 
 
 		 1394 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  38.57 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  41.18 
 
 		 226 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  30.7 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>