24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1805 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 133 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  97.74 
 
 		 133 aa  201  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  97.74 
 
 		 133 aa  201  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  57.66 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  66 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  60.53 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  55.4 
 
 		 139 aa  129  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  55.64 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  53.38 
 
 		 130 aa  123  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  59.38 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  49.61 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  33.06 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  31.19 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  32.48 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  32.06 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.16 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  34.07 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  27.43 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  36.79 
 
 		 1394 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  28.1 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  27.27 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  34.94 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  25.17 
 
 		 143 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>