15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3148 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  76.22 
 
 		 144 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  63.38 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  37.25 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  36.13 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  30.2 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  26 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  32.41 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2633  EF hand domain-containing protein  32.54 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  30 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  29.09 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  29.86 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  30.89 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>