43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3284 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  100 
 
 		 139 aa  276  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  37.5 
 
 		 218 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  36.54 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  36.94 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  36.07 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  36.89 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  35.65 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.13 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  30.15 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  31.9 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.3 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  30.09 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  41.58 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.26 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  30.95 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.69 
 
 		 291 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3738  signal transduction protein  29.57 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  26.77 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  31.45 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.3 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  26.62 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  30.09 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  31.53 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  29.84 
 
 		 198 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  33.93 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  32.98 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  32.26 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  25.76 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  38.67 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  28.78 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  41.67 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  28.45 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  30.48 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  29.5 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  34.34 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  32.67 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  29.5 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.99 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.71 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  28.48 
 
 		 282 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  41.67 
 
 		 390 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>