41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0416 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  100 
 
 		 218 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  94.95 
 
 		 212 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  76.56 
 
 		 124 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  41.72 
 
 		 164 aa  88.2  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  36.97 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  39.13 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  37.5 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  37.5 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  37.5 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  34.11 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  35.38 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  33.33 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  38.16 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  31.53 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.11 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.11 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  36.28 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.33 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2375  calcium-binding EF-hand protein  39.22 
 
 		 169 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.3 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  31.53 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  31.45 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  31.45 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  34.17 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  28.68 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.43 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  34.17 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  29.13 
 
 		 479 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.9 
 
 		 167 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  40.68 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  32.98 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.77 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  31.06 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  44.9 
 
 		 125 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.03 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  44 
 
 		 125 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  35.37 
 
 		 145 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  29.2 
 
 		 155 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>