14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3224 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  35.51 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  37.14 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  30.68 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  29.73 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12351  hypothetical protein  34.07 
 
 		 129 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.1 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.1 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  34.78 
 
 		 124 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  30.63 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  30.15 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0655  signal transduction protein  31.58 
 
 		 184 aa  42  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  29.13 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>