56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2148 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  32.59 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  32.21 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  30.53 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  35.48 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  35 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  33.64 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.13 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  30.88 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  33.91 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.87 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  26.17 
 
 		 212 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  32.5 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.5 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  29.25 
 
 		 212 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  25.31 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  27.91 
 
 		 242 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  34.69 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  30.36 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.83 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  28.3 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.35 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  28.18 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  28.19 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.48 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  30.71 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  27.88 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  31.25 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  26.98 
 
 		 282 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  43.14 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  24.16 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  30.48 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.48 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  49.02 
 
 		 173 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.75 
 
 		 2767 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  43.14 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  33.06 
 
 		 209 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  52 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  29.41 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.37 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  39.13 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.72 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  27.83 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  26.5 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  50 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  33.78 
 
 		 209 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  29.29 
 
 		 203 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  33.96 
 
 		 266 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  29.41 
 
 		 226 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  27.43 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  31.68 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  29.73 
 
 		 580 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  27.52 
 
 		 124 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>