34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2968 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 209 aa  413  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  37.68 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  37.64 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  36.76 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  32.54 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  31.93 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  28.92 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  33.57 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  34.15 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  31.74 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.14 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  32.86 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.61 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.61 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  31.33 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  51.06 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  40.24 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  32.43 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3121  EF hand domain-containing protein  38.37 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.29 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  36.59 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  46.43 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  31.3 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  29.25 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  44.44 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2224  signal transduction protein  31.71 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  53.33 
 
 		 132 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  35.29 
 
 		 167 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  27.46 
 
 		 139 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4424  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.76 
 
 		 160 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163959  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  31.9 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  31.9 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  26.6 
 
 		 282 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>