22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0097 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 132 aa  257  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0062  calcium-binding EF-hand-containing protein  48.18 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0042  calcium-binding EF-hand-containing protein  48.18 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.352285  normal  0.420457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  44.53 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3772  hypothetical protein  58.18 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  50.98 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  51.11 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  46.67 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  48.94 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  43.14 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  47.73 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  41.51 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  41.51 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  43.4 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  36.84 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  37.74 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  54.76 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1600  hypothetical protein  37.25 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04240  hypothetical protein  34.57 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1140  calcium-binding EF-hand-containing protein  44.44 
 
 		 269 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  36.62 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  32.41 
 
 		 135 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>