44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3135 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  100 
 
 		 164 aa  315  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  43.65 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  48.67 
 
 		 218 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  47.79 
 
 		 212 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  46.09 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  35.86 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  31.93 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  25.31 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  51.2  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  38.24 
 
 		 209 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  39.05 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.09 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  28.16 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  28.16 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  31.09 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2375  calcium-binding EF-hand protein  32.12 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  29.45 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  26.67 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.46 
 
 		 194 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  28.66 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  30.6 
 
 		 479 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  41.33 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  41.33 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.92 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.27 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.03 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  30.3 
 
 		 282 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  31.09 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  32.14 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2609  hypothetical protein  32.17 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.8 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  30.36 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  30.15 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  27.82 
 
 		 522 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  28.57 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4339  putative signal transduction protein with EFhand domain  35.59 
 
 		 256 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.1378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  32.28 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  32.48 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  29.61 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  27.34 
 
 		 226 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  31.21 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3688  signal transduction protein  35 
 
 		 252 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>