28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1482 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  38.06 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  38.06 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  33.16 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  35.4 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.35 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33.59 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  33.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.64 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  32.35 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  30.58 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.43 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  30 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  31.2 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  29.56 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  29.28 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  32.67 
 
 		 167 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  28.07 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  28.9 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  34.21 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  36.9 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  29.92 
 
 		 282 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.1 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  30.43 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2375  calcium-binding EF-hand protein  33.77 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  29.49 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  31.36 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.77 
 
 		 147 aa  41.2  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>