57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1110 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  62.89 
 
 		 193 aa  197  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  42.74 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  38.21 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  38.58 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.93 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  42.57 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.56 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  36.94 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0677  hypothetical protein  34.92 
 
 		 131 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  34.91 
 
 		 112 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  36.52 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  38.05 
 
 		 112 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  31.45 
 
 		 119 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  28.86 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  53.66 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  53.49 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  31.58 
 
 		 122 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  47.92 
 
 		 136 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2166  calcium-binding EF-hand  42.86 
 
 		 72 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.09 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  33.98 
 
 		 131 aa  47.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04241  EF hand domain protein  50 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  35.51 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  50 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  42.59 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04240  hypothetical protein  46.81 
 
 		 99 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  29.2 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  30.87 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  36.96 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  33.85 
 
 		 110 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  40.35 
 
 		 125 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  33.33 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2893  Calcium-binding EF-hand-containing protein  41.51 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  47.5 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  32.06 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  38.24 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13400  predicted protein  28.06 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.78 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1600  hypothetical protein  46.3 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  32.17 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  25.35 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  25.56 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0305  hypothetical protein  32.38 
 
 		 102 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.178613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  42.11 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  50 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  25.35 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  48.84 
 
 		 87 aa  42.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  28.05 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  29.55 
 
 		 97 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  28.05 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  36.84 
 
 		 209 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.77 
 
 		 225 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  41.3 
 
 		 122 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  40.91 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>