16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2165 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2166  calcium-binding EF-hand  43.94 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  53.66 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  47.73 
 
 		 266 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  38.78 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  47.73 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  47.62 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1600  hypothetical protein  43.48 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  50 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  46.51 
 
 		 135 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1362  EF hand domain-containing protein  30 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  41.67 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.55 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  41.3 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  38.1 
 
 		 202 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>