27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1266 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 167 aa  331  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.39 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  33.64 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  31.54 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.87 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.58 
 
 		 205 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  30.58 
 
 		 205 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  26.92 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.35 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  32.43 
 
 		 242 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  42.59 
 
 		 586 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.61 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  33.57 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  35.14 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  34.95 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  33.9 
 
 		 218 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  33.05 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  29.85 
 
 		 522 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2228  hypothetical protein  24.24 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256936  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  42.37 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  26.77 
 
 		 282 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  34.62 
 
 		 112 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 118 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  25.95 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  31.3 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  26.8 
 
 		 466 aa  40.8  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>