26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5532 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  81.85 
 
 		 292 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  31.13 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  35.42 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  26.62 
 
 		 522 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  26.54 
 
 		 163 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.27 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  24 
 
 		 466 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.96 
 
 		 167 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  25.95 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  27.78 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.97 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1459  hypothetical protein  44.68 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  35.09 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  31.25 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  22.6 
 
 		 209 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  32.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  25.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  25.17 
 
 		 163 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  31.58 
 
 		 212 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  26.24 
 
 		 194 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  35.65 
 
 		 148 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3337  calcium-binding EF-hand-containing protein  39.71 
 
 		 159 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  33.91 
 
 		 188 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  29.79 
 
 		 759 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>