48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4199 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  100 
 
 		 282 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  42.8 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  30.77 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  32.35 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2609  hypothetical protein  29.61 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.53 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.42 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  29.77 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0795  Calcium-binding EF-hand-containing protein  35.61 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447265 
 
 
-
 
NC_006686  CND00260  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  28 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.877349  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  28.67 
 
 		 522 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.5 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3121  EF hand domain-containing protein  39.56 
 
 		 154 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  27.07 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87042  predicted protein  27.15 
 
 		 174 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  28.47 
 
 		 149 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06566  calcineurin subunit B, putative (Eurofung)  25.85 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376236  normal  0.7072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.98 
 
 		 143 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  28.36 
 
 		 479 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  29.93 
 
 		 163 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  28.97 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  25.76 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  29.2 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  31.31 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  29.92 
 
 		 188 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  31.5 
 
 		 212 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1615  calcium-binding EF-hand  42.65 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  35.63 
 
 		 112 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3230  signal transduction protein  41.38 
 
 		 99 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.263542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  34.02 
 
 		 167 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  30.88 
 
 		 164 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  27.27 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35352  predicted protein  30 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0604437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5447  putative signal transduction protein with EFhand domain  27.21 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  30.71 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  25 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3688  signal transduction protein  43.08 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  28.69 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.38 
 
 		 125 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1545  Calcium-binding EF-hand-containing protein  24.89 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  26.9 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42946  predicted protein  31.13 
 
 		 457 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.21 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  32.11 
 
 		 190 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.28 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.57 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  28 
 
 		 153 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  36.36 
 
 		 124 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>