148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36397 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  100 
 
 		 759 aa  1554    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  37.69 
 
 		 904 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.79 
 
 		 903 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  36.07 
 
 		 909 aa  156  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.62 
 
 		 903 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  34.66 
 
 		 907 aa  149  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  35.29 
 
 		 909 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.85 
 
 		 903 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  32 
 
 		 880 aa  112  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.41 
 
 		 877 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.07 
 
 		 873 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  28.79 
 
 		 907 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.56 
 
 		 769 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.29 
 
 		 873 aa  101  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  28.04 
 
 		 880 aa  98.2  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 902 aa  98.2  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  29.21 
 
 		 904 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 875 aa  94.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  26.74 
 
 		 863 aa  92.8  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  26.27 
 
 		 890 aa  93.2  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  26.77 
 
 		 888 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  27.45 
 
 		 865 aa  91.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 880 aa  91.3  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  28.04 
 
 		 881 aa  91.3  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  28.06 
 
 		 875 aa  90.9  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  28.06 
 
 		 875 aa  90.9  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  23.83 
 
 		 845 aa  90.1  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  26.34 
 
 		 883 aa  89.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  25.09 
 
 		 877 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  25.58 
 
 		 863 aa  85.1  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  28.35 
 
 		 880 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  25.91 
 
 		 867 aa  83.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.65 
 
 		 892 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  28.41 
 
 		 872 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 432 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  27.65 
 
 		 874 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  26.42 
 
 		 898 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  26.91 
 
 		 1077 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  24.63 
 
 		 885 aa  77  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  26.79 
 
 		 896 aa  75.1  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.77 
 
 		 905 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  28.63 
 
 		 859 aa  68.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.19 
 
 		 888 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.45 
 
 		 854 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 		 214 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.49 
 
 		 821 aa  60.1  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  29.53 
 
 		 214 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.52 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  26.85 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  26.67 
 
 		 339 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  27.15 
 
 		 339 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.7 
 
 		 338 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  22.63 
 
 		 425 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  26.8 
 
 		 155 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 		 428 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  34.18 
 
 		 163 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.67 
 
 		 161 aa  53.9  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  25.68 
 
 		 379 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  24.84 
 
 		 141 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 		 141 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06566  calcineurin subunit B, putative (Eurofung)  32.5 
 
 		 181 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376236  normal  0.7072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 		 141 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  25.5 
 
 		 143 aa  51.6  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  37.88 
 
 		 466 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  28.29 
 
 		 154 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  26.85 
 
 		 219 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 		 141 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  26.17 
 
 		 281 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  27.1 
 
 		 143 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 		 279 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 		 141 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 		 141 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.3 
 
 		 161 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 		 141 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 		 142 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  26.45 
 
 		 138 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2569  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 		 171 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.77 
 
 		 242 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 		 142 aa  49.3  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  22 
 
 		 163 aa  49.3  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 150 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  25.68 
 
 		 153 aa  49.3  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  22.88 
 
 		 172 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0498  hypothetical protein  24.1 
 
 		 207 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1545  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.9 
 
 		 496 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  21.33 
 
 		 140 aa  48.5  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 		 225 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0819  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.21 
 
 		 500 aa  48.5  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  26.49 
 
 		 141 aa  48.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 		 391 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  26.17 
 
 		 221 aa  47.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  26.97 
 
 		 141 aa  48.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.1 
 
 		 223 aa  47.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  23.49 
 
 		 225 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  35.21 
 
 		 163 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>