More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3135 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  83.33 
 
 		 142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  74.29 
 
 		 142 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  74.29 
 
 		 141 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  74.29 
 
 		 141 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  74.29 
 
 		 141 aa  214  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  72.86 
 
 		 172 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  72.14 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  72.14 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  72.14 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  72.14 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  68.61 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  64.29 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  64.23 
 
 		 139 aa  189  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  64.23 
 
 		 139 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  34.56 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  35.04 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  34.78 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  31.39 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  30.66 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  31.91 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  33.81 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  27.07 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.91 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  30 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.79 
 
 		 598 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  28.37 
 
 		 210 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.06 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  25.71 
 
 		 373 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  28.68 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.37 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.64 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  30.15 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  31.01 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  26.21 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  28.36 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  23.85 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  26.72 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  26.72 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  29.32 
 
 		 513 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  26.47 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  27.01 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  26.72 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  30.22 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  31.75 
 
 		 487 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  31.01 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  30 
 
 		 502 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 		 636 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.34 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  27.82 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  28.47 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25.19 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  27.82 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  25.93 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  30.43 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  29.23 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  27.69 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  26.06 
 
 		 376 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 		 427 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  26.15 
 
 		 503 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  28.99 
 
 		 640 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  25.76 
 
 		 883 aa  53.9  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  29.86 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  27.34 
 
 		 379 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.69 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  26.92 
 
 		 579 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  25.56 
 
 		 490 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 		 873 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  29.71 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  26.77 
 
 		 280 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.32 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  27.21 
 
 		 378 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  27.69 
 
 		 488 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  25.71 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>