More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3778 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  460  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  86.67 
 
 		 225 aa  408  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  44.7 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  41.43 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  41.61 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  44.78 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  42.06 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  39.1 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  38.65 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 		 145 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  40.62 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  45.71 
 
 		 162 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  48.06 
 
 		 154 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  45.59 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  39.85 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  40.6 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  43.94 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  45 
 
 		 162 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  39.38 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  41.73 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  44.85 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  41.09 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  42.4 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 		 133 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  40.15 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  43.31 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  43.08 
 
 		 282 aa  90.9  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  33.58 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  43.28 
 
 		 149 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  34.91 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32.97 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  40.62 
 
 		 166 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  38.62 
 
 		 152 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  43.08 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  42.54 
 
 		 141 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  38.06 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  37.9 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  37.12 
 
 		 513 aa  84.7  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  36.13 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  38.13 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  42.65 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 279 aa  81.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  35.61 
 
 		 513 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  34.65 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  35.61 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  33.09 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  40.85 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  33.59 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  33.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  30.97 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  33.86 
 
 		 138 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  36.51 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  38.24 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 769 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  39.84 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  39.84 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  39.84 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  34.29 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34.27 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  34.44 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  36.36 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  37.98 
 
 		 867 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  40.62 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.06 
 
 		 845 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  35.94 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  29.38 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  32.26 
 
 		 880 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.97 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  36.05 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  36.05 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 144 aa  72  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.4 
 
 		 148 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  36.15 
 
 		 377 aa  72  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.46 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  38.41 
 
 		 904 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  34.51 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.08 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.65 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  31.47 
 
 		 890 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.78 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1197  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.9 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 		 863 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  30.6 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.86 
 
 		 903 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  39.23 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  34.78 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>