More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2466 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  88.19 
 
 
874 aa  1448    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
872 aa  1709    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  36.25 
 
 
907 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  34.34 
 
 
880 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  32.4 
 
 
877 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  34.94 
 
 
880 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  36.92 
 
 
880 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  36.66 
 
 
880 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  33.93 
 
 
875 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  33.71 
 
 
875 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  36.07 
 
 
881 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  35.79 
 
 
904 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
875 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.93 
 
 
888 aa  445  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 
896 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  31.49 
 
 
890 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  34.09 
 
 
898 aa  425  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.03 
 
 
892 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.3 
 
 
877 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  33.45 
 
 
888 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.01 
 
 
903 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.37 
 
 
873 aa  412  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  34.58 
 
 
867 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  33.81 
 
 
904 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 
873 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
885 aa  399  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 
902 aa  392  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.64 
 
 
907 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
863 aa  388  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.22 
 
 
845 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.46 
 
 
883 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
863 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  34 
 
 
905 aa  386  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  34.97 
 
 
909 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  32.86 
 
 
909 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.02 
 
 
903 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  28.13 
 
 
859 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.11 
 
 
903 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  29.08 
 
 
865 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.3 
 
 
769 aa  361  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.42 
 
 
854 aa  352  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.16 
 
 
847 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.84 
 
 
821 aa  251  4e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.95 
 
 
422 aa  224  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  29.55 
 
 
1077 aa  211  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  39.6 
 
 
404 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  32.58 
 
 
388 aa  191  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  31 
 
 
432 aa  187  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  34.52 
 
 
450 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.52 
 
 
450 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  45.49 
 
 
383 aa  167  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  30.9 
 
 
416 aa  164  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  31.13 
 
 
418 aa  163  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  35.08 
 
 
374 aa  162  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  39.83 
 
 
479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  29.6 
 
 
474 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  31.11 
 
 
483 aa  148  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  30.18 
 
 
418 aa  145  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
483 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.3 
 
 
468 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.92 
 
 
469 aa  142  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 
471 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.77 
 
 
484 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  34.19 
 
 
567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  38.03 
 
 
475 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
561 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  31.33 
 
 
403 aa  128  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  44.34 
 
 
448 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 
489 aa  124  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
470 aa  124  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  27.57 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  33.41 
 
 
404 aa  121  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03291  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.19 
 
 
421 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.418266  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  26.09 
 
 
477 aa  120  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.93 
 
 
495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  24.52 
 
 
415 aa  118  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  42.37 
 
 
377 aa  114  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  22.22 
 
 
415 aa  114  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
479 aa  112  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  22.89 
 
 
415 aa  112  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.46 
 
 
415 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  22.46 
 
 
415 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
467 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  33.76 
 
 
450 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
473 aa  105  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3833  polynucleotide adenylyltransferase region  28.84 
 
 
422 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
584 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0791  polyA polymerase  31 
 
 
412 aa  100  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.11993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0973  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.87 
 
 
474 aa  99  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  24.03 
 
 
418 aa  99.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 
484 aa  98.6  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  24.5 
 
 
418 aa  97.8  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  29.83 
 
 
485 aa  97.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2689  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  30.8 
 
 
407 aa  97.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  25.6 
 
 
398 aa  96.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
485 aa  95.1  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2026  multifunctional CCA protein  31.82 
 
 
376 aa  94.4  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3415  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  35.84 
 
 
406 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.617389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>