More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2494 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  85.45 
 
 		 428 aa  706    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 427 aa  829    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  51.32 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  39.77 
 
 		 436 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  39.63 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  34.74 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  34.38 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  33.97 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  32.86 
 
 		 413 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  31.68 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  28.13 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  53.64 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  47.27 
 
 		 110 aa  114  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  48.6 
 
 		 113 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  55.67 
 
 		 119 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  45.79 
 
 		 112 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  46.36 
 
 		 114 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  47.66 
 
 		 115 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  47.96 
 
 		 126 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  48.62 
 
 		 112 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  51.52 
 
 		 125 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  42.73 
 
 		 110 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  51.52 
 
 		 125 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  46.3 
 
 		 112 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  48 
 
 		 114 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  51.38 
 
 		 114 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.87 
 
 		 230 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  43.24 
 
 		 112 aa  97.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  41.07 
 
 		 130 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  46.3 
 
 		 114 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  44.12 
 
 		 116 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  43.24 
 
 		 128 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  41.61 
 
 		 234 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  44.76 
 
 		 131 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  46.46 
 
 		 123 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  38.3 
 
 		 249 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  43.14 
 
 		 115 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  37.32 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  37.76 
 
 		 229 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  40.14 
 
 		 221 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  38.78 
 
 		 223 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  47.87 
 
 		 102 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 241 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.84 
 
 		 242 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  42.24 
 
 		 114 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  38.32 
 
 		 114 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  35.85 
 
 		 229 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  40.18 
 
 		 119 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  40.18 
 
 		 119 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.8 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  38.57 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.73 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 		 148 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 153 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  26.82 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.77 
 
 		 154 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.6 
 
 		 279 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  27.93 
 
 		 313 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  38.85 
 
 		 246 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.78 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  35.71 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  24.19 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  36.18 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  34.69 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  41.28 
 
 		 114 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.79 
 
 		 152 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  33.78 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  48.28 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  25.08 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.91 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 242 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  36.99 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.2 
 
 		 152 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  22.71 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.59 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  36.42 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  34.21 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.93 
 
 		 153 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  38.26 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.32 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  32.65 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  35.84 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  39.18 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  37.86 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  38.19 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.43 
 
 		 231 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  37.86 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 242 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  37.86 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  35.46 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  37.86 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.81 
 
 		 149 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>