More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1801 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  79.73 
 
 		 149 aa  246  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  63.09 
 
 		 149 aa  209  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  63.09 
 
 		 149 aa  210  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  59.46 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  67.11 
 
 		 150 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  59.46 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  51.7 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  43.92 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  40.54 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.73 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  38.93 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  36.73 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  37.58 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  37.84 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  37.84 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  37.41 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  36.49 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.17 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  34.46 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  38.19 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.57 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  36.99 
 
 		 155 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 		 246 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  31.97 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 241 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36.81 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  32.21 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  32.21 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  37.06 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.27 
 
 		 247 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  37.06 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  34.27 
 
 		 246 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  35.42 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  34.97 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.39 
 
 		 231 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 		 242 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  38.57 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.82 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  27.21 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  30.14 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  34.27 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  37.86 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 		 338 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.91 
 
 		 249 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.77 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  31.54 
 
 		 339 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.72 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  33.57 
 
 		 243 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  31.97 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.61 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  33.56 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.85 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  32.62 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34.44 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  34.81 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  26.71 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  32.05 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 373 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.14 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  30.82 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  34.81 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  32.65 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  32.41 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  31.76 
 
 		 332 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  34.18 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  30.32 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  33.77 
 
 		 404 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 242 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  31.85 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  32.62 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  27.21 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  28.38 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  24.83 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 428 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  30.92 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  32.64 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  28.37 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.08 
 
 		 242 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  32.39 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  32.19 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>