More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2844 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  85.45 
 
 
427 aa  703    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  100 
 
 
428 aa  833    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  48.92 
 
 
427 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  40 
 
 
436 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  35.28 
 
 
426 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  38.69 
 
 
433 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
431 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  35.41 
 
 
417 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  34.44 
 
 
423 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  32.24 
 
 
414 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  27.34 
 
 
409 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  46.36 
 
 
110 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  46.73 
 
 
112 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  45.79 
 
 
113 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  46.94 
 
 
126 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  51.55 
 
 
119 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  42.59 
 
 
110 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  45.45 
 
 
114 aa  103  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  44.86 
 
 
115 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  44.95 
 
 
112 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  45.45 
 
 
112 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  46.46 
 
 
125 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  46.46 
 
 
125 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  41.33 
 
 
234 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  42.34 
 
 
112 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  40.18 
 
 
130 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  45.37 
 
 
114 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  44 
 
 
114 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  42.57 
 
 
116 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  45.45 
 
 
114 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  41.9 
 
 
131 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  42.34 
 
 
128 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  44 
 
 
123 aa  91.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  42.57 
 
 
115 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  28.12 
 
 
261 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  40.52 
 
 
114 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  36.45 
 
 
114 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  27.96 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.1 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.86 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.69 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  34.66 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  35.57 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  38.96 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  40.14 
 
 
339 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.88 
 
 
249 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  34.51 
 
 
230 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  41.76 
 
 
109 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  28.49 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  43.62 
 
 
102 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  47.67 
 
 
118 aa  81.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  34.23 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  35.71 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.33 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  37.14 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  31.41 
 
 
226 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  29.61 
 
 
230 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  34.84 
 
 
226 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  37.66 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  34.87 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  24.69 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  25.08 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  35.26 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  34.38 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  39.31 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 
228 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  34.84 
 
 
242 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  27.38 
 
 
660 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  35.66 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.2 
 
 
152 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  36.7 
 
 
116 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  33.11 
 
 
242 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  31.97 
 
 
242 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  34.59 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.48 
 
 
155 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  35.67 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  37.61 
 
 
114 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  38.57 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  38.57 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  38.57 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  38.57 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  35.19 
 
 
107 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  38.57 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  38.57 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  37.14 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  31.29 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  29.41 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>