More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0635 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 432 aa  894    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  38.68 
 
 		 769 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  36.94 
 
 		 907 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  36.09 
 
 		 880 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 		 873 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  35.7 
 
 		 880 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.91 
 
 		 877 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  34.97 
 
 		 875 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  34.98 
 
 		 877 aa  256  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  34.19 
 
 		 865 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.27 
 
 		 873 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  34.72 
 
 		 880 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  34.27 
 
 		 880 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  32.66 
 
 		 890 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 863 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 		 863 aa  236  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  32.62 
 
 		 902 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  34.27 
 
 		 904 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  31.62 
 
 		 888 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.67 
 
 		 845 aa  229  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  32.55 
 
 		 875 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 		 881 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  32.08 
 
 		 875 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32.02 
 
 		 867 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  32.17 
 
 		 907 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.95 
 
 		 903 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.23 
 
 		 892 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.72 
 
 		 909 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.49 
 
 		 903 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.05 
 
 		 903 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.53 
 
 		 888 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  30.35 
 
 		 904 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 885 aa  200  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  30.66 
 
 		 898 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  30.54 
 
 		 896 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.17 
 
 		 883 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.86 
 
 		 909 aa  195  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  31 
 
 		 872 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 		 874 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  27.29 
 
 		 859 aa  179  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  28.29 
 
 		 1077 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.6 
 
 		 854 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.67 
 
 		 905 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  25 
 
 		 847 aa  116  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.47 
 
 		 821 aa  113  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  28.97 
 
 		 759 aa  83.2  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  35.4 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.78 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.04 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32 
 
 		 605 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.43 
 
 		 141 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  31.62 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.79 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  33.05 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  33.33 
 
 		 212 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 		 225 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.68 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.06 
 
 		 320 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  37.17 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 378 aa  67  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  31.67 
 
 		 863 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.28 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 		 139 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 232 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  38.1 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  34.95 
 
 		 280 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  33.33 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  28.12 
 
 		 142 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  31.71 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  32.74 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  34.11 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  30.97 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.36 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  30.23 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  28.77 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  30.09 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28.81 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  29.82 
 
 		 139 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  33.61 
 
 		 879 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  33.61 
 
 		 879 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 139 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 139 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  30.97 
 
 		 139 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  33.64 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 		 144 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  31.91 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>