More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3288 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  290  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  83.33 
 
 		 141 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  78.1 
 
 		 141 aa  220  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  78.1 
 
 		 141 aa  220  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  78.1 
 
 		 141 aa  220  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  76.64 
 
 		 142 aa  219  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  75.91 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  73.72 
 
 		 141 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  73.72 
 
 		 141 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  73.72 
 
 		 141 aa  213  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  73.72 
 
 		 141 aa  213  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  70.07 
 
 		 139 aa  200  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  69.34 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  69.34 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 139 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  35.04 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  32.12 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  34.31 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  30.07 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  34.07 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  32.14 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  34.06 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  32.12 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  30.08 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  35.66 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 373 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  30.15 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  30.08 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.62 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  30.08 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  30.08 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  30.08 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  32.85 
 
 		 426 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  30.37 
 
 		 490 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  30.53 
 
 		 502 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  29.37 
 
 		 487 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  27.74 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  30.08 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 873 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  28.46 
 
 		 503 aa  58.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.53 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  26.62 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  25.71 
 
 		 232 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  30.77 
 
 		 579 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  25.74 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  23.13 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  25.95 
 
 		 883 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  27.82 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  29.32 
 
 		 500 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  28.46 
 
 		 488 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.21 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  27.74 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  24.62 
 
 		 511 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  25.18 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  25.19 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  28.15 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 640 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  25.19 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  28.77 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.59 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  24.46 
 
 		 280 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 390 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 217 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.16 
 
 		 209 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  27.07 
 
 		 513 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4441  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.46 
 
 		 490 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  26.62 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  25.19 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  29.23 
 
 		 503 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 211 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.08 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.77 
 
 		 605 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  27.13 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  23.36 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 		 383 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>