More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3655 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  99.29 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  99.29 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  98.58 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  88.65 
 
 		 142 aa  264  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  90.07 
 
 		 141 aa  263  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  90.07 
 
 		 141 aa  263  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  90.07 
 
 		 141 aa  263  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  85.82 
 
 		 172 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  73.72 
 
 		 142 aa  213  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  72.14 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  71.22 
 
 		 139 aa  206  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  69.29 
 
 		 140 aa  203  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  68.35 
 
 		 139 aa  202  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  66.91 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  29.93 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  32.12 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  28.99 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  30.43 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  30.66 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  31.43 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  29.2 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  30.43 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  30.6 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 873 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  30.6 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  30.6 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  31.3 
 
 		 502 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  30.77 
 
 		 500 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  29.23 
 
 		 490 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  28.46 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.34 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  27.69 
 
 		 503 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  30.22 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  28.24 
 
 		 502 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.3 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 211 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  31.43 
 
 		 640 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  29.85 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  28.23 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  29.17 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  30.22 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  28.24 
 
 		 883 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  30.22 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  29.1 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 		 399 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.77 
 
 		 605 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  29.08 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  28.8 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  27.21 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  27.69 
 
 		 503 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 		 386 aa  53.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  26.15 
 
 		 579 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  26.62 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  25.71 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.66 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  28.03 
 
 		 382 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  25.17 
 
 		 246 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  25.95 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  28.03 
 
 		 490 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  25.95 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  26.06 
 
 		 890 aa  52  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 		 373 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  21.43 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 279 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 279 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 		 256 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  29.17 
 
 		 378 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  28.46 
 
 		 513 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  25.95 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  29.23 
 
 		 513 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  23.94 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  26.09 
 
 		 376 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 162 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  24.26 
 
 		 223 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  26.92 
 
 		 511 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 382 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  24.84 
 
 		 759 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  26.92 
 
 		 500 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  26.98 
 
 		 487 aa  50.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28.68 
 
 		 877 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.47 
 
 		 845 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 		 391 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  29.71 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  27.01 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>