More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1517 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  62.15 
 
 
502 aa  654    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  63.94 
 
 
503 aa  680    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  69.94 
 
 
502 aa  738    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1015    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  69.92 
 
 
502 aa  733    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  58.32 
 
 
503 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  54.2 
 
 
500 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  51.9 
 
 
500 aa  567  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  50.68 
 
 
513 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  50.29 
 
 
513 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  49.9 
 
 
513 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  48.43 
 
 
513 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  47.38 
 
 
511 aa  498  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  50 
 
 
399 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  50.66 
 
 
412 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  49.35 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  46.21 
 
 
423 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  48.01 
 
 
406 aa  349  7e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  47.1 
 
 
408 aa  345  7e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  48.3 
 
 
407 aa  345  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  47.25 
 
 
408 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  45.59 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  47.56 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  46.53 
 
 
390 aa  333  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  49.08 
 
 
405 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  43.25 
 
 
455 aa  330  3e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  45.07 
 
 
438 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  44.59 
 
 
389 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  42.64 
 
 
403 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  44.01 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  44 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  42.4 
 
 
390 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  43.47 
 
 
404 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  43.47 
 
 
404 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  44.77 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  45.6 
 
 
421 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  43.77 
 
 
389 aa  307  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  43.34 
 
 
388 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  33.23 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  33.96 
 
 
413 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  33.64 
 
 
418 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  30.37 
 
 
405 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  29.87 
 
 
427 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  31.68 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  31.54 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  45.38 
 
 
488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  31.15 
 
 
388 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  31.15 
 
 
388 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  29.63 
 
 
438 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  30.71 
 
 
410 aa  109  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  45.38 
 
 
491 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  45.38 
 
 
490 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  42.86 
 
 
496 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  43.59 
 
 
490 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  27.24 
 
 
388 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  43.1 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
579 aa  90.1  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  34.35 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 
256 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  36.15 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.25 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
139 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  32.23 
 
 
137 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  29.84 
 
 
124 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  31.4 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 
137 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.08 
 
 
223 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
215 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2674  signal transduction protein  29.41 
 
 
166 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  hitchhiker  0.0000000000000277355 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 
279 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.22 
 
 
246 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.93 
 
 
769 aa  64.7  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  32.23 
 
 
300 aa  64.3  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
141 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 
279 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  32.06 
 
 
141 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  32.48 
 
 
379 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
232 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
141 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
142 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  36.52 
 
 
867 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  35.29 
 
 
141 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
376 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
279 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
208 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.13 
 
 
313 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
141 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  35.4 
 
 
845 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
282 aa  61.6  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
625 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 
142 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
139 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 
217 aa  60.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
215 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.85 
 
 
282 aa  60.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
152 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  38.84 
 
 
877 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
225 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
216 aa  60.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>