More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02666 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 139 aa  283  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  51.94 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  50 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  44.93 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  46.09 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  43.07 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  45.31 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  40.15 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  42.19 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  43.75 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  43.85 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 		 142 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  43.08 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  42.97 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  39.53 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  37.4 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  34.29 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 642 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 642 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  28.91 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  28.91 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  28.91 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  29.69 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  22.86 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  30.65 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  32.69 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  29.08 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  30.15 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.79 
 
 		 862 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.21 
 
 		 597 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 		 643 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  26.72 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.94 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  32.86 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  29.08 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  28.57 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 		 625 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  26.52 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.33 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  22.86 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  22.86 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  22.86 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  29.2 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 219 aa  57  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  24.81 
 
 		 500 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  29.46 
 
 		 141 aa  57  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 256 aa  57  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 225 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 216 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  23.13 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  29.6 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  26.67 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  27.54 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  23.62 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.91 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  23.74 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  22.14 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  25.4 
 
 		 492 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  23.48 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  33.08 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  33.08 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  23.7 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  24.43 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  22.22 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  21.43 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  21.43 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  33.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  33.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  33.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  27.74 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  33.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  27.82 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  33.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  22.73 
 
 		 258 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>