More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3056 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 143 aa  280  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  50 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  51.43 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  71.15 
 
 		 104 aa  151  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  53.85 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  54.23 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  52.82 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  54.23 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  54.23 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  54.23 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  52.82 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  52.82 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  50.69 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  52.82 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  50 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  51.08 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  53.15 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  52.82 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  53.19 
 
 		 144 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  52.14 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  50.7 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  54.35 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  51.77 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  52.48 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  47.83 
 
 		 141 aa  143  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  51.77 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  51.77 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  51.77 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  51.77 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  51.77 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  51.77 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  51.77 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  51.75 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  50.7 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  49.65 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  51.72 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  51.75 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  50.7 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  46.04 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  50.7 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  53.15 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  48.23 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  48.23 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  46.81 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  46.43 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  45.11 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  46.81 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  43.57 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  45.39 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  46.1 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  43.57 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  44.37 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  48.31 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  49.19 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  42.75 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  42.75 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  42.86 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  40.58 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  35.21 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  41.3 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  41.3 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.8 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  43.26 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  38.03 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.57 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  37.68 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  40.29 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.01 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  39.01 
 
 		 143 aa  93.2  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  39.16 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  40.74 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  38.3 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  41.01 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  42.31 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  39.57 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  39.57 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  40 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  39.01 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  37.59 
 
 		 174 aa  88.6  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  39.01 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  39.84 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  37.29 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  36.17 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  38.14 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  40.74 
 
 		 688 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 		 688 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  34.68 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  37.86 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  34.68 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>