More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0990 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  69.63 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  73.13 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  73.13 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  73.13 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  73.13 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  70.9 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  70.15 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  70.15 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  69.4 
 
 		 143 aa  185  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  68.66 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  64.18 
 
 		 134 aa  176  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  61.48 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  64.89 
 
 		 152 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  55.56 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  50 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  47.79 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  48.85 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  48.85 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  43.08 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  41.04 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  37.69 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 225 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  43.85 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  43.85 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  43.85 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  40 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  38.35 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  34.88 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  33.08 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  38.4 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  38.35 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  39.55 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.11 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  32.81 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  37.86 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  38.03 
 
 		 223 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 256 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  31.01 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 636 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  33.82 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  30.5 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  34.59 
 
 		 282 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  39.23 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  32.31 
 
 		 380 aa  70.5  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 688 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 865 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  34.09 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.71 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  34.33 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.34 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.53 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.6 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  34.59 
 
 		 640 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.47 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.56 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  37.61 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  37.12 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.08 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.72 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.47 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  38.17 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  34.85 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  30.07 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  35.16 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  32.8 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.51 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 313 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  34.11 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.09 
 
 		 862 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  32.64 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  32.59 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  35.61 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.86 
 
 		 246 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  31.82 
 
 		 688 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  32.81 
 
 		 272 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  38.78 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  30.88 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  32.54 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>