More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2078 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2078  CBS  100 
 
 		 142 aa  283  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  77.86 
 
 		 142 aa  213  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  73.38 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  61.43 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  59.29 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  41.84 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  43.36 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  40.29 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  41.79 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  42.11 
 
 		 166 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  39.55 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  39.55 
 
 		 640 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  40.6 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  40.6 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  40.6 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 172 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  41.48 
 
 		 214 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  38.64 
 
 		 214 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  38.24 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  30.66 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  33.82 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  33.82 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  33.82 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  33.82 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  33.82 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  33.82 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  33.82 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  33.82 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  33.82 
 
 		 214 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  31.01 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.5 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.34 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.25 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 636 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  31.01 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 		 216 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  31.5 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  31.3 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  32.28 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.89 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  34.29 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.06 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 432 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  28.28 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  30.66 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  30.66 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  30.83 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  29.63 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  30.08 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  27.94 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  30.08 
 
 		 216 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 688 aa  63.9  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.08 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  31.54 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  28.68 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  31.45 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  29.63 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  34.07 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.01 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  30.23 
 
 		 277 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>