More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2668 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 277 aa  551  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  58.78 
 
 		 279 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  40.35 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  39.71 
 
 		 279 aa  211  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  39.44 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 252 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  43.08 
 
 		 225 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  41.54 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  37.59 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  32.43 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  25.81 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 		 885 aa  79  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  35.56 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.51 
 
 		 903 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  34.96 
 
 		 907 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.4 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  32.87 
 
 		 875 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  26.19 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  35.77 
 
 		 909 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  33.57 
 
 		 875 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  28.25 
 
 		 873 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.13 
 
 		 903 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  36.51 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  27.81 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  33.81 
 
 		 904 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.71 
 
 		 903 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  34.96 
 
 		 909 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  25.36 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.36 
 
 		 877 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.97 
 
 		 769 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.8 
 
 		 877 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.06 
 
 		 865 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  25.6 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0535  CBS domain-containing protein  25.56 
 
 		 658 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.672261  normal  0.0583682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 875 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  26.6 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  34.21 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  33.33 
 
 		 411 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  27.54 
 
 		 1560 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  40 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 152 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.61 
 
 		 873 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.65 
 
 		 888 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  31.75 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 134 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.07 
 
 		 845 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.14 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  33.58 
 
 		 890 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  34.09 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  23.94 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  34.56 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  32.67 
 
 		 606 aa  66.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.33 
 
 		 907 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 863 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  26.22 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.88 
 
 		 605 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.54 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.63 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  25.73 
 
 		 660 aa  65.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  26.15 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  29.25 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  27.48 
 
 		 880 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  27.78 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32.8 
 
 		 867 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 143 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  25.99 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  34.38 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  31.11 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2710  CBS domain-containing membrane protein  34.33 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.828048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  31.75 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  31.39 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>