More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0304 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  100 
 
 		 261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  43.46 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  41.15 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  33.99 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  29.05 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  27.8 
 
 		 427 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.62 
 
 		 380 aa  82.4  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.93 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 428 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  27.8 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  27.6 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  34.53 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 153 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  36.69 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  27.84 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  23.44 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  32.37 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  23.08 
 
 		 427 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  24.63 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  25.56 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  26.13 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.72 
 
 		 769 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  21.72 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  36.02 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.02 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.96 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  26.9 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  32.86 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  39.53 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  24.27 
 
 		 423 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  22.34 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.61 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.35 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  30 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  38.98 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  31.91 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  26.43 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  23.77 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.29 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  23.11 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  34.07 
 
 		 377 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.42 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  27.92 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 1274 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  26.76 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.56 
 
 		 907 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  40.68 
 
 		 490 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  25.48 
 
 		 433 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 641 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.82 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.37 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  25.98 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  27.35 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  33.12 
 
 		 904 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.75 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.39 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.32 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.52 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  24.44 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.89 
 
 		 845 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.32 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  26.15 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  40.57 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  28.12 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.077992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  31.45 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  29.71 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  25.38 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  22.26 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  28.67 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.94 
 
 		 489 aa  62  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  28.21 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2358  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.61 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.890412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  27.6 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  25.76 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  29.75 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.77 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.32 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.58 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.99 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>