More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1915 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  44.13 
 
 
210 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  42.72 
 
 
214 aa  148  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  38.86 
 
 
221 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  35.75 
 
 
208 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  37.85 
 
 
210 aa  131  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  44.38 
 
 
215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  37.31 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  38.42 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  38.92 
 
 
216 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  38.86 
 
 
209 aa  125  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  36.78 
 
 
224 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  40.67 
 
 
216 aa  124  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
256 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  42.2 
 
 
212 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  35.03 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  42.11 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36.45 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  34.6 
 
 
220 aa  117  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  36.15 
 
 
217 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  34.48 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  34.55 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  42.34 
 
 
219 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  39.23 
 
 
211 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  32.38 
 
 
214 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  36.79 
 
 
215 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.57 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  31.75 
 
 
214 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  32.7 
 
 
217 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 
217 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  36.49 
 
 
216 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  35.23 
 
 
202 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  32.46 
 
 
227 aa  101  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
230 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  29.94 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
145 aa  95.9  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  34.07 
 
 
142 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  28.1 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  28.1 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  29.59 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  28.1 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  28.1 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  28.1 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  28.1 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  28.1 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  28.1 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  28.1 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2674  signal transduction protein  37.5 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  hitchhiker  0.0000000000000277355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  27.62 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  28.9 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 
141 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  31.54 
 
 
138 aa  77  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  38.28 
 
 
640 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.33 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.35 
 
 
769 aa  75.1  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 
143 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0437  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.48 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0448  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.48 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.82 
 
 
482 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.82 
 
 
482 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32 
 
 
145 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  30.37 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  29.86 
 
 
147 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  34.15 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.58 
 
 
508 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  36.43 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.23 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  30.3 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 
366 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  32.82 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.91 
 
 
147 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.47 
 
 
488 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 
391 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  34.56 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.29 
 
 
489 aa  66.2  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  34.68 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.35 
 
 
483 aa  65.9  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  32.58 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  30.28 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>