More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004370 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  100 
 
 		 149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  90.15 
 
 		 154 aa  247  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  71.81 
 
 		 169 aa  223  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  63.7 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  42.86 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  42.55 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  42.25 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  41.01 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  39.23 
 
 		 214 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  36.76 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  36.92 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  39.67 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  39.67 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  38.84 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  38.84 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  35.57 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  38.84 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  38.84 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  38.84 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  38.84 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  38.84 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  36.43 
 
 		 210 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  38.84 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 		 232 aa  77.4  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  36.76 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  36.76 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  36.76 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  36.92 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  33.08 
 
 		 492 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  36.13 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  33.8 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.75 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 225 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.57 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.8 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  34.33 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.71 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.61 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  32.43 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  35.82 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.08 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  30.16 
 
 		 688 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.43 
 
 		 488 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  33.91 
 
 		 640 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  34.31 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 172 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 688 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  31.71 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.94 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.78 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.31 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  26.57 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  33.08 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.54 
 
 		 490 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.88 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.59 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.75 
 
 		 867 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.05 
 
 		 862 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 489 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  35.25 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.59 
 
 		 520 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  32.79 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  33.02 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 		 427 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 		 432 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  29.77 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  26.57 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.08 
 
 		 513 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>