More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3837 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3055  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.95 
 
 
505 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2585  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.93 
 
 
507 aa  689    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  64.17 
 
 
517 aa  653    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
498 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.57 
 
 
514 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6535  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.13 
 
 
503 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.22 
 
 
500 aa  710    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.89 
 
 
504 aa  694    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.4 
 
 
501 aa  745    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.15 
 
 
517 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16510  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.45 
 
 
514 aa  664    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00613898  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 
503 aa  658    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
520 aa  1035    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2587  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.46 
 
 
503 aa  669    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000196974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0636  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.09 
 
 
537 aa  680    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.48 
 
 
529 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.29 
 
 
495 aa  741    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5998  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.47 
 
 
597 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.68 
 
 
514 aa  646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  68.9 
 
 
493 aa  688    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.39 
 
 
492 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  97.12 
 
 
520 aa  983    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.35 
 
 
517 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4023  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.98 
 
 
498 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836954  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.64 
 
 
510 aa  741    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.08 
 
 
500 aa  713    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.35 
 
 
517 aa  688    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 
507 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0687  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.42 
 
 
501 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.559264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2879  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
503 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0154703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.92 
 
 
513 aa  710    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.21 
 
 
516 aa  727    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.64 
 
 
514 aa  656    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.01 
 
 
500 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08690  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.46 
 
 
499 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0432795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.56 
 
 
517 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.61 
 
 
498 aa  712    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.75 
 
 
517 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
490 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.81 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.99 
 
 
485 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
485 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  57.64 
 
 
484 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.76 
 
 
488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.52 
 
 
488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.5 
 
 
498 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.26 
 
 
498 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.64 
 
 
485 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.64 
 
 
488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.55 
 
 
498 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.32 
 
 
491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.18 
 
 
491 aa  568  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.17 
 
 
494 aa  569  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.26 
 
 
498 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.2 
 
 
504 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.67 
 
 
493 aa  569  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.23 
 
 
496 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.39 
 
 
489 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
498 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.66 
 
 
497 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.85 
 
 
487 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.1 
 
 
487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.3 
 
 
486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.7 
 
 
488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.55 
 
 
489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.43 
 
 
496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.61 
 
 
493 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.43 
 
 
496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.26 
 
 
500 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.21 
 
 
487 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.89 
 
 
487 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.52 
 
 
495 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.61 
 
 
492 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.49 
 
 
496 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.01 
 
 
487 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.76 
 
 
489 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.04 
 
 
497 aa  558  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.8 
 
 
487 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.96 
 
 
499 aa  557  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.21 
 
 
487 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.01 
 
 
487 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.8 
 
 
487 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.01 
 
 
487 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.52 
 
 
491 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.8 
 
 
487 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.21 
 
 
487 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.66 
 
 
497 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.59 
 
 
485 aa  556  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.44 
 
 
491 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.56 
 
 
489 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.12 
 
 
486 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.12 
 
 
485 aa  551  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.91 
 
 
547 aa  552  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.06 
 
 
482 aa  552  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.65 
 
 
483 aa  549  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.22 
 
 
481 aa  549  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.67 
 
 
508 aa  549  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.21 
 
 
483 aa  549  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.26 
 
 
496 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>