More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1213 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  77.14 
 
 
514 aa  791    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.53 
 
 
520 aa  685    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.92 
 
 
520 aa  686    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08690  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.25 
 
 
499 aa  637    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0432795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.92 
 
 
500 aa  685    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.78 
 
 
501 aa  722    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  73.13 
 
 
517 aa  740    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.8 
 
 
492 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.34 
 
 
529 aa  720    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  73.13 
 
 
517 aa  715    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.93 
 
 
503 aa  729    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5998  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.84 
 
 
597 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
513 aa  1026    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2587  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.46 
 
 
503 aa  654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000196974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0636  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.17 
 
 
537 aa  687    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67 
 
 
498 aa  669    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.17 
 
 
500 aa  697    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16510  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.55 
 
 
514 aa  647    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00613898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6535  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.65 
 
 
503 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.1 
 
 
510 aa  706    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  68.97 
 
 
493 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.71 
 
 
514 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  73.13 
 
 
517 aa  740    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2585  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.53 
 
 
507 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.88 
 
 
507 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4023  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.78 
 
 
498 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836954  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.21 
 
 
498 aa  675    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2879  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.66 
 
 
503 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0154703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.46 
 
 
504 aa  658    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.21 
 
 
495 aa  678    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.01 
 
 
516 aa  731    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3645  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.14 
 
 
500 aa  652    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  73.13 
 
 
517 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1511  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  73.74 
 
 
517 aa  721    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3055  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.32 
 
 
505 aa  631  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0687  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.03 
 
 
501 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.559264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1899  IMP dehydrogenase/GMP reductase  60.98 
 
 
517 aa  616  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.66 
 
 
514 aa  615  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.76 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.11 
 
 
490 aa  580  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.55 
 
 
493 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.2 
 
 
485 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.28 
 
 
493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.78 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.83 
 
 
494 aa  569  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.42 
 
 
491 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.67 
 
 
488 aa  567  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.1 
 
 
504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.94 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  55.89 
 
 
484 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  56.1 
 
 
484 aa  559  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.59 
 
 
488 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.32 
 
 
492 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.64 
 
 
504 aa  558  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.12 
 
 
484 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.26 
 
 
485 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.38 
 
 
488 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.08 
 
 
486 aa  551  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.42 
 
 
503 aa  551  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.58 
 
 
487 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.92 
 
 
485 aa  549  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.78 
 
 
487 aa  545  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.13 
 
 
489 aa  545  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.38 
 
 
487 aa  541  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.58 
 
 
487 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.4 
 
 
491 aa  544  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.38 
 
 
487 aa  541  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.38 
 
 
487 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.38 
 
 
487 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.38 
 
 
487 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.38 
 
 
487 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.56 
 
 
490 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.38 
 
 
487 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.96 
 
 
507 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.69 
 
 
486 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.17 
 
 
487 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.3 
 
 
489 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.58 
 
 
489 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  54.19 
 
 
481 aa  535  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.13 
 
 
486 aa  535  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.89 
 
 
483 aa  536  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.93 
 
 
493 aa  538  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.69 
 
 
508 aa  534  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.37 
 
 
489 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.67 
 
 
491 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.38 
 
 
490 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.66 
 
 
482 aa  534  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.21 
 
 
547 aa  531  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.49 
 
 
487 aa  531  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.78 
 
 
483 aa  533  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.07 
 
 
491 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.52 
 
 
486 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.65 
 
 
485 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.96 
 
 
490 aa  528  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0069  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.14 
 
 
488 aa  526  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.7 
 
 
487 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.88 
 
 
498 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.7 
 
 
487 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.89 
 
 
482 aa  528  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.03 
 
 
489 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.221976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>