More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0405 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  979    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.71 
 
 
494 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.53 
 
 
496 aa  677    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 
482 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.51 
 
 
494 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.96 
 
 
496 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.7 
 
 
499 aa  657    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.72 
 
 
497 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.45 
 
 
510 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.88 
 
 
484 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.88 
 
 
500 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.34 
 
 
497 aa  712    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.54 
 
 
498 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.69 
 
 
498 aa  723    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 
482 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.96 
 
 
496 aa  718    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.74 
 
 
487 aa  659    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.89 
 
 
498 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  82.99 
 
 
500 aa  808    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 
500 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.8 
 
 
482 aa  646    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.27 
 
 
497 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.36 
 
 
496 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.89 
 
 
498 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.66 
 
 
498 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.52 
 
 
497 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.4 
 
 
499 aa  634    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  80.33 
 
 
485 aa  803    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.8 
 
 
500 aa  663    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.54 
 
 
495 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.69 
 
 
489 aa  665    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.55 
 
 
496 aa  716    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.28 
 
 
487 aa  680    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.02 
 
 
486 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.18 
 
 
482 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.67 
 
 
497 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.77 
 
 
482 aa  630  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  66.88 
 
 
532 aa  626  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.67 
 
 
497 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.67 
 
 
497 aa  623  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.35 
 
 
482 aa  621  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.08 
 
 
491 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.67 
 
 
504 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 
489 aa  586  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.95 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  58.13 
 
 
484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.54 
 
 
488 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.75 
 
 
487 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.75 
 
 
487 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 
486 aa  579  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
485 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.38 
 
 
491 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.7 
 
 
493 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.96 
 
 
491 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.54 
 
 
492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.4 
 
 
499 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.71 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.29 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.02 
 
 
508 aa  576  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.7 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.49 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.16 
 
 
484 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
490 aa  568  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58 
 
 
489 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.29 
 
 
493 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.28 
 
 
486 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.93 
 
 
491 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.87 
 
 
490 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.84 
 
 
514 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.59 
 
 
490 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.13 
 
 
507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  58.42 
 
 
486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.69 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1900  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.59 
 
 
490 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.07 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.03 
 
 
488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.05 
 
 
500 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.21 
 
 
483 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.89 
 
 
485 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.07 
 
 
489 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.55 
 
 
495 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.65 
 
 
487 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
520 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.21 
 
 
490 aa  560  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.81 
 
 
483 aa  561  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.87 
 
 
489 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.91 
 
 
485 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.11 
 
 
489 aa  555  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.71 
 
 
490 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.86 
 
 
487 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.23 
 
 
490 aa  556  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 
520 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.33 
 
 
485 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.02 
 
 
485 aa  555  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.74 
 
 
517 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.74 
 
 
517 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.04 
 
 
486 aa  555  1e-157  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>