More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1224 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.19 
 
 
496 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.57 
 
 
498 aa  634    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  86.31 
 
 
482 aa  838    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  85.68 
 
 
482 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 
495 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.62 
 
 
496 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
498 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.46 
 
 
498 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  84.23 
 
 
482 aa  838    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.98 
 
 
496 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.84 
 
 
498 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.77 
 
 
498 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  86.31 
 
 
482 aa  838    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  968    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.98 
 
 
496 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.17 
 
 
486 aa  667    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  83.68 
 
 
484 aa  830    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  82.99 
 
 
482 aa  813    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.8 
 
 
487 aa  632  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 
497 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.23 
 
 
497 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 
497 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 
485 aa  625  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.95 
 
 
497 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.35 
 
 
485 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.35 
 
 
500 aa  622  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.9 
 
 
494 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.91 
 
 
496 aa  617  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.64 
 
 
510 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.33 
 
 
500 aa  616  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.99 
 
 
489 aa  615  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.69 
 
 
494 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.22 
 
 
499 aa  611  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.99 
 
 
500 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.86 
 
 
497 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.86 
 
 
497 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.22 
 
 
499 aa  598  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.33 
 
 
500 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.03 
 
 
497 aa  601  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.81 
 
 
487 aa  597  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
489 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
488 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
487 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  59.83 
 
 
486 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  64.66 
 
 
532 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.33 
 
 
486 aa  585  1e-166  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.71 
 
 
489 aa  586  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.09 
 
 
489 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 
488 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.13 
 
 
491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.8 
 
 
486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.8 
 
 
486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
488 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.92 
 
 
491 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.13 
 
 
487 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
488 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.8 
 
 
488 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.42 
 
 
488 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
488 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
488 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.8 
 
 
488 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4242  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.8 
 
 
488 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.59 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.59 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.59 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.92 
 
 
491 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.59 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  57.38 
 
 
484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.59 
 
 
488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.13 
 
 
488 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.05 
 
 
490 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.84 
 
 
487 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  57.73 
 
 
490 aa  568  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.64 
 
 
490 aa  569  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0409  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.84 
 
 
515 aa  570  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000774513  decreased coverage  0.00000719153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1302  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.84 
 
 
487 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000015836  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.64 
 
 
490 aa  569  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61 
 
 
488 aa  569  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
488 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1127  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.58 
 
 
487 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00407073  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2876  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
488 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112732  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  57.73 
 
 
490 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58 
 
 
490 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.47 
 
 
487 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.85 
 
 
482 aa  567  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.3 
 
 
487 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2767  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
488 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268112  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2704  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
488 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139604  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.26 
 
 
487 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0651  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.68 
 
 
485 aa  566  1e-160  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2745  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
488 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00565207  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2660  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.17 
 
 
488 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000716462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3004  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00999222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.82 
 
 
490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.47 
 
 
491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.84 
 
 
504 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>