More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0040 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  77.71 
 
 
499 aa  751    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 
496 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.7 
 
 
497 aa  634    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 
495 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 
496 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.57 
 
 
498 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.87 
 
 
498 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.33 
 
 
487 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.99 
 
 
497 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.23 
 
 
498 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.85 
 
 
496 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 
497 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.74 
 
 
496 aa  653    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.84 
 
 
498 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 
498 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.32 
 
 
486 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.45 
 
 
487 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 
500 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
497 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
500 aa  1004    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.97 
 
 
494 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.97 
 
 
494 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.88 
 
 
485 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.26 
 
 
497 aa  648    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.3 
 
 
496 aa  633  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.43 
 
 
510 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.25 
 
 
485 aa  633  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.77 
 
 
489 aa  631  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.49 
 
 
497 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.49 
 
 
497 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.22 
 
 
499 aa  627  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.07 
 
 
484 aa  627  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.52 
 
 
500 aa  624  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.28 
 
 
482 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  64.66 
 
 
532 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.71 
 
 
500 aa  611  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.28 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.28 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.35 
 
 
482 aa  608  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.66 
 
 
482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.28 
 
 
482 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.71 
 
 
491 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  61.86 
 
 
486 aa  589  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.73 
 
 
487 aa  584  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.93 
 
 
487 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.73 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.65 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.92 
 
 
491 aa  581  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.26 
 
 
491 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.47 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.64 
 
 
488 aa  571  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.49 
 
 
499 aa  571  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.63 
 
 
486 aa  568  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.85 
 
 
489 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.4 
 
 
508 aa  565  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
489 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.64 
 
 
489 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
486 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  57.49 
 
 
490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  57.49 
 
 
490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.21 
 
 
492 aa  562  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
556 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  56.96 
 
 
484 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.88 
 
 
488 aa  561  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.01 
 
 
497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.95 
 
 
489 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
487 aa  561  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.22 
 
 
483 aa  560  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.1 
 
 
490 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.05 
 
 
489 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
487 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.41 
 
 
486 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.41 
 
 
486 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.35 
 
 
490 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.97 
 
 
488 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.75 
 
 
494 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.68 
 
 
482 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.13 
 
 
493 aa  557  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.68 
 
 
482 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.67 
 
 
490 aa  555  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.62 
 
 
487 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
487 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.17 
 
 
485 aa  555  1e-157  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60 
 
 
486 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.53 
 
 
486 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60 
 
 
486 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.67 
 
 
490 aa  555  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60 
 
 
486 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.67 
 
 
493 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.59 
 
 
486 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>