More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0084 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.84 
 
 
499 aa  688    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.79 
 
 
487 aa  681    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.34 
 
 
485 aa  706    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.73 
 
 
494 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  89.54 
 
 
497 aa  884    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  92.34 
 
 
496 aa  933    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.28 
 
 
497 aa  680    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.11 
 
 
496 aa  722    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  92.34 
 
 
496 aa  933    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  73.54 
 
 
494 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  74.14 
 
 
532 aa  699    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.49 
 
 
498 aa  746    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  92.34 
 
 
496 aa  935    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.95 
 
 
498 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  75.51 
 
 
495 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.88 
 
 
497 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.81 
 
 
487 aa  663    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  87.93 
 
 
497 aa  890    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  76.03 
 
 
498 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 
500 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.7 
 
 
497 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.31 
 
 
496 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  76.43 
 
 
498 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.28 
 
 
497 aa  681    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  74.28 
 
 
498 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
497 aa  1003    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.43 
 
 
485 aa  693    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  73.83 
 
 
500 aa  712    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  79.01 
 
 
510 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
500 aa  646    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 
489 aa  680    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.77 
 
 
484 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.02 
 
 
486 aa  714    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  75.25 
 
 
500 aa  733    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.25 
 
 
499 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.15 
 
 
482 aa  622  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 
482 aa  617  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 
482 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.71 
 
 
482 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.71 
 
 
482 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.71 
 
 
482 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 
491 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.12 
 
 
486 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.93 
 
 
492 aa  588  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.88 
 
 
491 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.18 
 
 
499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
491 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.56 
 
 
491 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
488 aa  579  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.07 
 
 
487 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  59.34 
 
 
486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.38 
 
 
485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.99 
 
 
493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.54 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.71 
 
 
486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.08 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.38 
 
 
508 aa  573  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.33 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.33 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.56 
 
 
489 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.47 
 
 
489 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.26 
 
 
485 aa  571  1e-161  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.26 
 
 
486 aa  568  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.7 
 
 
556 aa  568  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.05 
 
 
490 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.32 
 
 
489 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.68 
 
 
487 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.11 
 
 
489 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.82 
 
 
493 aa  567  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.7 
 
 
485 aa  568  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.16 
 
 
487 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
504 aa  567  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.38 
 
 
490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.3 
 
 
490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.08 
 
 
487 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.82 
 
 
486 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.88 
 
 
486 aa  558  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.23 
 
 
482 aa  560  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.62 
 
 
488 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.59 
 
 
485 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.64 
 
 
507 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.2 
 
 
489 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1900  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
488 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.44 
 
 
482 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.25 
 
 
487 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.14 
 
 
494 aa  558  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.14 
 
 
486 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  56.88 
 
 
490 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  56.88 
 
 
490 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.23 
 
 
487 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.88 
 
 
485 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.27 
 
 
517 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.61 
 
 
487 aa  557  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.68 
 
 
485 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  57.14 
 
 
484 aa  557  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.94 
 
 
514 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.88 
 
 
494 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>