More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1752 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 		 496 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  82.99 
 
 		 485 aa  813    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.64 
 
 		 500 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.51 
 
 		 498 aa  687    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.98 
 
 		 486 aa  704    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.43 
 
 		 510 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.52 
 
 		 487 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.94 
 
 		 498 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 500 aa  1010    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.02 
 
 		 494 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.15 
 
 		 497 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.71 
 
 		 496 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.53 
 
 		 498 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.92 
 
 		 498 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.21 
 
 		 498 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 		 499 aa  656    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  79.79 
 
 		 485 aa  795    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.42 
 
 		 484 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.94 
 
 		 500 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.09 
 
 		 497 aa  673    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.12 
 
 		 489 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.63 
 
 		 487 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 		 497 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.29 
 
 		 496 aa  683    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.95 
 
 		 497 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 		 496 aa  661    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.52 
 
 		 500 aa  636    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.71 
 
 		 496 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.98 
 
 		 495 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.33 
 
 		 499 aa  631  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 		 482 aa  632  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.76 
 
 		 494 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.54 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.95 
 
 		 482 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.51 
 
 		 497 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.95 
 
 		 482 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.91 
 
 		 497 aa  625  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.91 
 
 		 497 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  66.18 
 
 		 532 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.33 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 482 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.11 
 
 		 487 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.59 
 
 		 504 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.9 
 
 		 487 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.9 
 
 		 487 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.41 
 
 		 487 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.71 
 
 		 488 aa  588  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  58.66 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.88 
 
 		 491 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.87 
 
 		 491 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.83 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  60.33 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.59 
 
 		 491 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.92 
 
 		 486 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.5 
 
 		 485 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.47 
 
 		 491 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.92 
 
 		 489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.3 
 
 		 483 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.39 
 
 		 490 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.87 
 
 		 486 aa  571  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.87 
 
 		 486 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.95 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.35 
 
 		 556 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.16 
 
 		 492 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.49 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.42 
 
 		 494 aa  571  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  55.93 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.67 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.68 
 
 		 499 aa  565  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.47 
 
 		 489 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.85 
 
 		 488 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.46 
 
 		 486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.93 
 
 		 488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.88 
 
 		 490 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.76 
 
 		 490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1900  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.56 
 
 		 488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.26 
 
 		 489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.41 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.37 
 
 		 488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.76 
 
 		 490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.51 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 		 487 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.18 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.25 
 
 		 487 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.17 
 
 		 494 aa  560  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.08 
 
 		 487 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.52 
 
 		 489 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.38 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0089  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.96 
 
 		 494 aa  556  1e-157  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0800118  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  57.26 
 
 		 490 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  57.26 
 
 		 490 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.96 
 
 		 487 aa  558  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.17 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.44 
 
 		 486 aa  557  1e-157  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.95 
 
 		 482 aa  556  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.39 
 
 		 483 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.67 
 
 		 489 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  56.16 
 
 		 484 aa  558  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  56.76 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>