More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1175 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.18 
 
 
499 aa  647    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.92 
 
 
497 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.02 
 
 
496 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.26 
 
 
497 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.69 
 
 
485 aa  661    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.89 
 
 
497 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.46 
 
 
497 aa  651    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.01 
 
 
494 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.46 
 
 
497 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.72 
 
 
495 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.14 
 
 
486 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.97 
 
 
498 aa  684    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.99 
 
 
496 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.6 
 
 
500 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.97 
 
 
487 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.83 
 
 
494 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.58 
 
 
498 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.31 
 
 
497 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.52 
 
 
496 aa  688    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.79 
 
 
498 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.58 
 
 
498 aa  685    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.42 
 
 
498 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  69.83 
 
 
532 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.06 
 
 
485 aa  673    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.33 
 
 
500 aa  661    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.99 
 
 
496 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
489 aa  986    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 
487 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.97 
 
 
496 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 
497 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.1 
 
 
510 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.77 
 
 
500 aa  631  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.12 
 
 
500 aa  631  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.58 
 
 
484 aa  623  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.2 
 
 
482 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.99 
 
 
482 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.99 
 
 
482 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.19 
 
 
499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.37 
 
 
482 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.99 
 
 
482 aa  599  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.93 
 
 
482 aa  596  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.05 
 
 
486 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.78 
 
 
556 aa  578  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.78 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.47 
 
 
486 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
487 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  58.02 
 
 
486 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.55 
 
 
489 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.32 
 
 
491 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.29 
 
 
493 aa  565  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
485 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.73 
 
 
487 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.53 
 
 
486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1949  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.8 
 
 
485 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  56.73 
 
 
490 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.99 
 
 
487 aa  561  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
487 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.76 
 
 
487 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1682  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.55 
 
 
514 aa  558  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.35 
 
 
487 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.29 
 
 
487 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  56.53 
 
 
490 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.4 
 
 
486 aa  555  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.29 
 
 
491 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.42 
 
 
486 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.58 
 
 
486 aa  558  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.44 
 
 
485 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.35 
 
 
487 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  56.2 
 
 
484 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.4 
 
 
488 aa  558  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.26 
 
 
488 aa  552  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.26 
 
 
488 aa  555  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.08 
 
 
487 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.17 
 
 
490 aa  553  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.82 
 
 
487 aa  552  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.26 
 
 
488 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
486 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.17 
 
 
490 aa  551  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.08 
 
 
487 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.64 
 
 
486 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.17 
 
 
490 aa  553  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.05 
 
 
486 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.53 
 
 
488 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.76 
 
 
485 aa  551  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.05 
 
 
486 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.53 
 
 
488 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.38 
 
 
489 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.85 
 
 
486 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.67 
 
 
491 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.22 
 
 
485 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.06 
 
 
488 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  57.06 
 
 
488 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.11 
 
 
489 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.44 
 
 
486 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.94 
 
 
489 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>