More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2213 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0040  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.45 
 
 
500 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116515  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.09 
 
 
486 aa  695    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.92 
 
 
496 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.67 
 
 
484 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.99 
 
 
496 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.28 
 
 
485 aa  674    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.15 
 
 
498 aa  684    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.97 
 
 
496 aa  678    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.98 
 
 
499 aa  643    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 
500 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.97 
 
 
498 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.14 
 
 
498 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.76 
 
 
497 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.1 
 
 
497 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 
498 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.94 
 
 
498 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.01 
 
 
494 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  977    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.74 
 
 
485 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0467  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.98 
 
 
500 aa  634    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.8 
 
 
494 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3123  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.98 
 
 
510 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1175  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 
489 aa  667    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.654831  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.74 
 
 
496 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.38 
 
 
497 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.79 
 
 
497 aa  681    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.93 
 
 
495 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.99 
 
 
496 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0244  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.05 
 
 
487 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20132  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0592  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.8 
 
 
482 aa  631  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.63 
 
 
500 aa  628  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1982  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.8 
 
 
482 aa  630  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.311927  normal  0.313546 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3052  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.7 
 
 
497 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5770  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 
532 aa  626  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0352  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.7 
 
 
497 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0319  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.7 
 
 
497 aa  624  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.39 
 
 
482 aa  621  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.39 
 
 
482 aa  621  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.8 
 
 
482 aa  617  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.18 
 
 
482 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.7 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.79 
 
 
486 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.08 
 
 
491 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.66 
 
 
499 aa  584  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.49 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.08 
 
 
487 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
491 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.8 
 
 
491 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
491 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.65 
 
 
514 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 
487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.12 
 
 
517 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.12 
 
 
517 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  58.42 
 
 
484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 
489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.92 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.25 
 
 
487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.92 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.25 
 
 
487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.92 
 
 
517 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
487 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
487 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.25 
 
 
489 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.9 
 
 
487 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.51 
 
 
486 aa  571  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.78 
 
 
503 aa  568  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.21 
 
 
488 aa  568  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.26 
 
 
556 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
487 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.13 
 
 
486 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.02 
 
 
486 aa  566  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.09 
 
 
487 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.29 
 
 
493 aa  565  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.8 
 
 
489 aa  567  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.21 
 
 
489 aa  568  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.58 
 
 
493 aa  567  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.63 
 
 
485 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.51 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.25 
 
 
492 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.49 
 
 
508 aa  559  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.46 
 
 
486 aa  559  1e-158  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1900  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.96 
 
 
488 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.56 
 
 
489 aa  561  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.61 
 
 
483 aa  560  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.71 
 
 
486 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  57.59 
 
 
486 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.54 
 
 
486 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.13 
 
 
486 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>