More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3015 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
488 aa  993    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.81 
 
 
486 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  62.47 
 
 
484 aa  622  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.5 
 
 
491 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  60.57 
 
 
486 aa  616  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.76 
 
 
489 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1913  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.66 
 
 
486 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.16 
 
 
487 aa  614  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.07 
 
 
486 aa  611  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.49 
 
 
488 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.62 
 
 
496 aa  609  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.19 
 
 
494 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.2 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  60 
 
 
490 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  60 
 
 
490 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.6 
 
 
556 aa  604  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61 
 
 
496 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.2 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.12 
 
 
486 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.62 
 
 
484 aa  604  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.41 
 
 
497 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.46 
 
 
489 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.12 
 
 
491 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.83 
 
 
491 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.43 
 
 
486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.42 
 
 
491 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.87 
 
 
493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.78 
 
 
487 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
487 aa  599  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 
486 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1777  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.71 
 
 
486 aa  598  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.814385  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.88 
 
 
508 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.11 
 
 
486 aa  601  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
486 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.42 
 
 
487 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
487 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.41 
 
 
486 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
496 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.62 
 
 
497 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.55 
 
 
486 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0730  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.89 
 
 
489 aa  598  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
487 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.93 
 
 
489 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.39 
 
 
489 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1453  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.71 
 
 
486 aa  598  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.136087  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 
487 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.87 
 
 
498 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.45 
 
 
498 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.24 
 
 
495 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3124  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.88 
 
 
489 aa  596  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
486 aa  595  1e-169  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 
487 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  59.79 
 
 
484 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.32 
 
 
488 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
489 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.32 
 
 
488 aa  595  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.16 
 
 
487 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.7 
 
 
488 aa  591  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.83 
 
 
507 aa  594  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.11 
 
 
488 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
486 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.26 
 
 
485 aa  594  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1289  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.2 
 
 
497 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.01 
 
 
488 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1302  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.16 
 
 
487 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000015836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.37 
 
 
489 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.75 
 
 
486 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0084  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.96 
 
 
497 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3004  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.19 
 
 
488 aa  591  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00999222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.51 
 
 
498 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.42 
 
 
490 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.98 
 
 
490 aa  593  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
486 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.11 
 
 
488 aa  594  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.91 
 
 
488 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.04 
 
 
488 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.55 
 
 
486 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 
486 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1194  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.45 
 
 
499 aa  591  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0718304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0409  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.16 
 
 
515 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000774513  decreased coverage  0.00000719153 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.47 
 
 
499 aa  590  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.42 
 
 
487 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.73 
 
 
486 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.09 
 
 
494 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.73 
 
 
486 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.73 
 
 
486 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1900  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.21 
 
 
488 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.84 
 
 
498 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.78 
 
 
489 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.41 
 
 
498 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.79 
 
 
487 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.66 
 
 
487 aa  589  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.73 
 
 
486 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  58.73 
 
 
486 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.67 
 
 
488 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.78 
 
 
488 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.14 
 
 
486 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.82 
 
 
485 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>