More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2549 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1029  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.02 
 
 		 489 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1031  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.82 
 
 		 489 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.66 
 
 		 489 aa  754    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.08 
 
 		 487 aa  691    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1682  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.83 
 
 		 514 aa  671    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.88 
 
 		 487 aa  800    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  96.5 
 
 		 486 aa  943    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.82 
 
 		 489 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1449  inosine-5-monophosphate dehydrogenase  69.4 
 
 		 489 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1777  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 		 486 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.814385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.49 
 
 		 486 aa  684    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  987    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  987    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  67.01 
 
 		 490 aa  686    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  67.01 
 
 		 490 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.61 
 
 		 489 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.24 
 
 		 490 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.31 
 
 		 487 aa  733    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1246  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.73 
 
 		 491 aa  740    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 487 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.85 
 
 		 487 aa  792    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.66 
 
 		 486 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  67.7 
 
 		 486 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.02 
 
 		 489 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  77.82 
 
 		 487 aa  772    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  96.3 
 
 		 486 aa  944    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.12 
 
 		 486 aa  663    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  987    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.99 
 
 		 486 aa  731    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.66 
 
 		 487 aa  736    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  98.97 
 
 		 486 aa  981    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2061  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.05 
 
 		 489 aa  741    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144949 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1532  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.74 
 
 		 485 aa  652    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.8 
 
 		 486 aa  926    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  987    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.39 
 
 		 489 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 		 556 aa  675    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  78.64 
 
 		 487 aa  791    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.1 
 
 		 486 aa  767    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2440  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.23 
 
 		 489 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.39 
 
 		 486 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39730  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.02 
 
 		 489 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1589  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.74 
 
 		 485 aa  653    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  77.21 
 
 		 487 aa  780    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.24 
 
 		 490 aa  639    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.08 
 
 		 487 aa  809    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1453  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 		 486 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.136087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  92.18 
 
 		 486 aa  911    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.71 
 
 		 491 aa  688    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  96.09 
 
 		 486 aa  942    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  96.5 
 
 		 486 aa  947    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2001  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.03 
 
 		 489 aa  729    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.488937 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  987    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 489 aa  693    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1014  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.82 
 
 		 488 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3008  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.91 
 
 		 491 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0175212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1913  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.72 
 
 		 486 aa  665    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  96.3 
 
 		 486 aa  944    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4148  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.24 
 
 		 488 aa  634    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0201579  normal  0.112689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2761  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.37 
 
 		 489 aa  696    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  96.5 
 
 		 486 aa  947    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 489 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00905  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.18 
 
 		 485 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0297709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.71 
 
 		 491 aa  688    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.88 
 
 		 485 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1285  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  95.88 
 
 		 486 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0259426  normal  0.434243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.23 
 
 		 489 aa  747    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1035  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.34 
 
 		 486 aa  660    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.04 
 
 		 494 aa  675    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.76 
 
 		 490 aa  634  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0730  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.36 
 
 		 489 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1346  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.17 
 
 		 489 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.5 
 
 		 489 aa  630  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15310  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.17 
 
 		 489 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10306  hitchhiker  4.2499e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.33 
 
 		 491 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.92 
 
 		 488 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.63 
 
 		 488 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 		 488 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.92 
 
 		 488 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.11 
 
 		 487 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.24 
 
 		 490 aa  621  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.11 
 
 		 487 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.6 
 
 		 489 aa  624  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 		 488 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.12 
 
 		 488 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.92 
 
 		 488 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.92 
 
 		 488 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.99 
 
 		 487 aa  618  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.92 
 
 		 488 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.7 
 
 		 487 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4242  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.7 
 
 		 490 aa  617  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.49 
 
 		 491 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.71 
 
 		 488 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.11 
 
 		 487 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.6 
 
 		 490 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1431  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.45 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.6 
 
 		 491 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  63.51 
 
 		 488 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>